FC Vysočina Jihlava působí v české nejvyšší soutěži 7. sezonu, čímž se mezi aktuálními ligovými kluby řadí na předposlední 15. místo. Vůbec poprvé ve své historii postoupila do 1. ligy v roce 2005 (stejně jako o 5 let dříve do 2. ligy), ale hned ji opět opustila. Na návrat zpět poté čekala dalších 6 let – od roku 2012 nyní hraje již 6. prvoligový ročník v řadě.

Nejlépe si vedla v sezoně 2013/2014, kdy skončila 8., naopak nejhůře ve výše uvedeném premiérovém ročníku 2005/2006, v němž obsadila 15. příčku (o 2 body za Plzní a 3 před Blšany) a po roce se vrátila o soutěž níž. Loni se zachránila až v předposledním kole po remíze se sestupující Příbramí, při shodném počtu bodů s Hradcem Králové v konečné tabulce rozhodlo v její prospěch o gól lepší skóre ze vzájemných zápasů.

V historii samostatné české nejvyšší fotbalové soutěže Jihlava dosud sehrála 197 zápasů s bilancí 51-56-90. Z utkání proti současným prvoligovým klubům si připsala největší počet vítězství se Slavií a s Brnem (s oběma 6), remíz s Libercem (také 6) a porážek se Spartou (9). Ještě nikdy nevyhrála nad Bohemians a Karvinou, s kterou prohrála všechny 3 zápasy, loni v dubnu však vůbec poprvé dokázala porazit Spartu.

Nejvýraznější výhru zaznamenala v březnu 2014 nad Olomoucí – 5:0, v srpnu 2013 rozstřílela Znojmo 4:0 (oba poražené týmy ve zmíněné sezoně sestoupily). V květnu 2015 zdolala Liberec také 4:0. Naopak nejt잚í prohry utrpěla v listopadu 2015 v Mladé Boleslavi – 1:6 a hned 4x 0:5 – v listopadu 2013 v Příbrami, o 2 ½ roku později na Spartě a naposledy 2x po sobě v Jablonci – v březnu a v září 2017.

Oba celky se zatím v 1. lize utkaly 13x s bilancí 8-3-2. Z prvních 7 zápasů (do roku 2014) vyhrála Viktoria pouze 2 (a také 2 prohrála), poté (od 2015) zvítězila již 6x za sebou. Poslední 3 domácí utkání skončila shodně 2:0. Na soupeřově půdě Plzeň ještě ani 1x neudržela čisté konto (!), doma pak dostala jediný gól. Od jihlavského návratu do 1. ligy (2012) vždy platí, že podzimní zápas hostí Vysočina a jarní odvetu Viktoria.

V této sezoně se Jihlavě příliš nedaří, již od začátku se pohybuje na dně ligové tabulky a přezimovala na posledním místě. Navíc jako jediná ještě nebodovala venku, kde prohrála všech 8 utkání. O obrovské překvapení se však postarala v uplynulém kole, v němž udolala obhájce titulu 1:0. Během svého současného šestiletého působení zůstala v domácích zápasech se Slavií neporažena a i celkově s ní má aktivní bilanci.