Střední obránce Jakub Navrátil odstartoval svou fotbalovou kariéru v Táboře. Svému mateřskému klubu zůstal věrný až do konce roku 2003, kdy v necelých dvaceti letech přestoupil z divizního celku do ligové Příbrami. V jejím dresu pak nasbíral své první zkušenosti v Gambrinus ligy, ve které má nyní odehráno více než stovku zápasů. Zajímavostí je, že svůj debut v české nejvyšší soutěži zaznamenal v dubnu 2004 právě proti plzeňské Viktorii. Po čtyřech letech u Litavky přestoupil do Štruncových sadů a ke konci ročníku 2007/08 se natrvalo usadil v základní jedenáctce západočeského klubu. V současnosti je 193 centimetrů vysoký stoper s výbornou hrou hlavou stálým členem prvního týmu Západočechů.