FC Vysočina Jihlava působí v české nejvyí soutěi 7. sezonu, čím se mezi aktuálními ligovými kluby řadí na předposlední 15. místo. Vůbec poprvé ve své historii postoupila do 1. ligy v roce 2005 (stejně jako o 5 let dříve do 2. ligy), ale hned ji opět opustila. Na návrat zpět poté čekala dalích 6 let od roku 2012 nyní hraje ji 6. prvoligový ročník v řadě.
Nejlépe si vedla v sezoně 2013/2014, kdy skončila 8., naopak nejhůře ve výe uvedeném premiérovém ročníku 2005/2006, v něm obsadila 15. příčku (o 2 body za Plzní a 3 před Blany) a po roce se vrátila o soutě ní. Loni se zachránila a v předposledním kole po remíze se sestupující Příbramí, při shodném počtu bodů s Hradcem Králové v konečné tabulce rozhodlo v její prospěch o gól lepí skóre ze vzájemných zápasů.V historii samostatné české nejvyí fotbalové soutěe Jihlava dosud sehrála 197 zápasů s bilancí 51-56-90. Z utkání proti současným prvoligovým klubům si připsala největí počet vítězství se Slavií a s Brnem (s oběma 6), remíz s Libercem (také 6) a poráek se Spartou (9). Jetě nikdy nevyhrála nad Bohemians a Karvinou, s kterou prohrála vechny 3 zápasy, loni v dubnu vak vůbec poprvé dokázala porazit Spartu.
Nejvýraznějí výhru zaznamenala v březnu 2014 nad Olomoucí 5:0, v srpnu 2013 rozstřílela Znojmo 4:0 (oba poraené týmy ve zmíněné sezoně sestoupily). V květnu 2015 zdolala Liberec také 4:0. Naopak nejtěí prohry utrpěla v listopadu 2015 v Mladé Boleslavi 1:6 a hned 4x 0:5 v listopadu 2013 v Příbrami, o 2 ½ roku později na Spartě a naposledy 2x po sobě v Jablonci v březnu a v září 2017.
Oba celky se zatím v 1. lize utkaly 13x s bilancí 8-3-2. Z prvních 7 zápasů (do roku 2014) vyhrála Viktoria pouze 2 (a také 2 prohrála), poté (od 2015) zvítězila ji 6x za sebou. Poslední 3 domácí utkání skončila shodně 2:0. Na soupeřově půdě Plzeň jetě ani 1x neudrela čisté konto (!), doma pak dostala jediný gól. Od jihlavského návratu do 1. ligy (2012) vdy platí, e podzimní zápas hostí Vysočina a jarní odvetu Viktoria.
V této sezoně se Jihlavě příli nedaří, ji od začátku se pohybuje na dně ligové tabulky a přezimovala na posledním místě. Navíc jako jediná jetě nebodovala venku, kde prohrála vech 8 utkání. O obrovské překvapení se vak postarala v uplynulém kole, v něm udolala obhájce titulu 1:0. Během svého současného estiletého působení zůstala v domácích zápasech se Slavií neporaena a i celkově s ní má aktivní bilanci.